Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXG3

Ift57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift57Q8BXG3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ift57Q8BXG3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ift57Q8BXG3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ift57Q8BXG3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ift57Q8BXG3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ift57Q8BXG3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ift57Q8BXG3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ift57Q8BXG3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ift57Q8BXG3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ift57Q8BXG3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ift57Q8BXG3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ift57Q8BXG3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ift57Q8BXG3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ift57Q8BXG3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ift57Q8BXG3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ift57Q8BXG3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ift57Q8BXG3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ift57Q8BXG3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ift57Q8BXG3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ift57Q8BXG3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ift57Q8BXG3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ift57Q8BXG3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ift57Q8BXG3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ift57Q8BXG3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ift57Q8BXG3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ift57Q8BXG3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ift57Q8BXG3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ift57Q8BXG3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ift57Q8BXG3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ift57Q8BXG3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ift57Q8BXG3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ift57Q8BXG3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ift57Q8BXG3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ift57Q8BXG3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ift57Q8BXG3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ift57Q8BXG3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ift57Q8BXG3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ift57Q8BXG3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ift57Q8BXG3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ift57Q8BXG3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ift57Q8BXG3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ift57Q8BXG3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ift57Q8BXG3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ift57Q8BXG3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ift57Q8BXG3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ift57Q8BXG3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ift57Q8BXG3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ift57Q8BXG3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ift57Q8BXG3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ift57Q8BXG3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms