Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Skor1Q8BX46 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Skor1Q8BX46 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Skor1Q8BX46 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Skor1Q8BX46 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Skor1Q8BX46 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Skor1Q8BX46 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Skor1Q8BX46 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Skor1Q8BX46 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Skor1Q8BX46 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Skor1Q8BX46 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Skor1Q8BX46 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Skor1Q8BX46 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Skor1Q8BX46 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Skor1Q8BX46 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Skor1Q8BX46 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Skor1Q8BX46 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Skor1Q8BX46 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Skor1Q8BX46 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Skor1Q8BX46 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Skor1Q8BX46 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Skor1Q8BX46 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Skor1Q8BX46 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Skor1Q8BX46 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Skor1Q8BX46 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Skor1Q8BX46 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Skor1Q8BX46 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Skor1Q8BX46 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Skor1Q8BX46 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Skor1Q8BX46 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Skor1Q8BX46 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Skor1Q8BX46 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Skor1Q8BX46 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Skor1Q8BX46 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skor1Q8BX46 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skor1Q8BX46 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skor1Q8BX46 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skor1Q8BX46 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Skor1Q8BX46 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Skor1Q8BX46 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Skor1Q8BX46 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Skor1Q8BX46 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Skor1Q8BX46 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Skor1Q8BX46 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Skor1Q8BX46 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skor1Q8BX46 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skor1Q8BX46 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skor1Q8BX46 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Skor1Q8BX46 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Skor1Q8BX46 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Skor1Q8BX46 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Skor1Q8BX46 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Skor1Q8BX46 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Skor1Q8BX46 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Skor1Q8BX46 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Skor1Q8BX46 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skor1Q8BX46 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms