Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx17Q8BVL3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx17Q8BVL3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx17Q8BVL3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx17Q8BVL3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx17Q8BVL3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx17Q8BVL3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx17Q8BVL3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx17Q8BVL3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx17Q8BVL3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx17Q8BVL3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx17Q8BVL3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx17Q8BVL3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx17Q8BVL3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx17Q8BVL3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx17Q8BVL3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx17Q8BVL3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snx17Q8BVL3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snx17Q8BVL3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snx17Q8BVL3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snx17Q8BVL3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snx17Q8BVL3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snx17Q8BVL3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx17Q8BVL3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx17Q8BVL3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx17Q8BVL3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx17Q8BVL3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx17Q8BVL3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx17Q8BVL3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx17Q8BVL3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx17Q8BVL3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx17Q8BVL3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Snx17Q8BVL3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx17Q8BVL3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx17Q8BVL3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx17Q8BVL3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx17Q8BVL3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx17Q8BVL3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx17Q8BVL3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx17Q8BVL3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx17Q8BVL3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx17Q8BVL3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx17Q8BVL3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx17Q8BVL3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx17Q8BVL3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx17Q8BVL3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx17Q8BVL3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx17Q8BVL3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx17Q8BVL3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx17Q8BVL3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx17Q8BVL3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx17Q8BVL3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
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