Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdcl3Q8BVF2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdcl3Q8BVF2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdcl3Q8BVF2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdcl3Q8BVF2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdcl3Q8BVF2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcl3Q8BVF2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdcl3Q8BVF2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdcl3Q8BVF2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdcl3Q8BVF2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdcl3Q8BVF2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdcl3Q8BVF2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcl3Q8BVF2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdcl3Q8BVF2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcl3Q8BVF2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdcl3Q8BVF2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcl3Q8BVF2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcl3Q8BVF2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcl3Q8BVF2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcl3Q8BVF2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pdcl3Q8BVF2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pdcl3Q8BVF2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdcl3Q8BVF2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcl3Q8BVF2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcl3Q8BVF2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcl3Q8BVF2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdcl3Q8BVF2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdcl3Q8BVF2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdcl3Q8BVF2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdcl3Q8BVF2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcl3Q8BVF2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcl3Q8BVF2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcl3Q8BVF2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcl3Q8BVF2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcl3Q8BVF2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdcl3Q8BVF2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdcl3Q8BVF2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdcl3Q8BVF2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdcl3Q8BVF2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms