Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPZ8

Abraxas1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas1Q8BPZ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abraxas1Q8BPZ8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abraxas1Q8BPZ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abraxas1Q8BPZ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abraxas1Q8BPZ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abraxas1Q8BPZ8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abraxas1Q8BPZ8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Abraxas1Q8BPZ8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abraxas1Q8BPZ8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abraxas1Q8BPZ8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abraxas1Q8BPZ8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Abraxas1Q8BPZ8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abraxas1Q8BPZ8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abraxas1Q8BPZ8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abraxas1Q8BPZ8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abraxas1Q8BPZ8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abraxas1Q8BPZ8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abraxas1Q8BPZ8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Abraxas1Q8BPZ8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abraxas1Q8BPZ8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms