Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp1Q8BJQ2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp1Q8BJQ2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp1Q8BJQ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp1Q8BJQ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp1Q8BJQ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp1Q8BJQ2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp1Q8BJQ2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp1Q8BJQ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp1Q8BJQ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp1Q8BJQ2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp1Q8BJQ2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp1Q8BJQ2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp1Q8BJQ2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp1Q8BJQ2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp1Q8BJQ2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp1Q8BJQ2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp1Q8BJQ2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp1Q8BJQ2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp1Q8BJQ2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp1Q8BJQ2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp1Q8BJQ2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp1Q8BJQ2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp1Q8BJQ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp1Q8BJQ2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp1Q8BJQ2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp1Q8BJQ2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp1Q8BJQ2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp1Q8BJQ2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp1Q8BJQ2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp1Q8BJQ2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp1Q8BJQ2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp1Q8BJQ2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp1Q8BJQ2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp1Q8BJQ2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp1Q8BJQ2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp1Q8BJQ2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp1Q8BJQ2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp1Q8BJQ2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp1Q8BJQ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms