Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF0

Cd99l2, CD99 antigen-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd99l2Q8BIF0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd99l2Q8BIF0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd99l2Q8BIF0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd99l2Q8BIF0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd99l2Q8BIF0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms