Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2af1l4Q8BGJ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
U2af1l4Q8BGJ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
U2af1l4Q8BGJ9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
U2af1l4Q8BGJ9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
U2af1l4Q8BGJ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
U2af1l4Q8BGJ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
U2af1l4Q8BGJ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
U2af1l4Q8BGJ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
U2af1l4Q8BGJ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
U2af1l4Q8BGJ9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
U2af1l4Q8BGJ9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
U2af1l4Q8BGJ9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
U2af1l4Q8BGJ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2af1l4Q8BGJ9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2af1l4Q8BGJ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2af1l4Q8BGJ9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms