Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcsk9Q80W65 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcsk9Q80W65 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcsk9Q80W65 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms