Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2eQ80UW8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2eQ80UW8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2eQ80UW8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2eQ80UW8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2eQ80UW8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2eQ80UW8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2eQ80UW8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2eQ80UW8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2eQ80UW8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2eQ80UW8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2eQ80UW8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2eQ80UW8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2eQ80UW8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2eQ80UW8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2eQ80UW8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr2eQ80UW8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr2eQ80UW8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr2eQ80UW8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2eQ80UW8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Polr2eQ80UW8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms