Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rab3gap1Q80UJ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rab3gap1Q80UJ7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rab3gap1Q80UJ7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rab3gap1Q80UJ7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rab3gap1Q80UJ7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rab3gap1Q80UJ7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rab3gap1Q80UJ7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rab3gap1Q80UJ7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rab3gap1Q80UJ7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rab3gap1Q80UJ7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rab3gap1Q80UJ7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rab3gap1Q80UJ7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rab3gap1Q80UJ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rab3gap1Q80UJ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rab3gap1Q80UJ7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab3gap1Q80UJ7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab3gap1Q80UJ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab3gap1Q80UJ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab3gap1Q80UJ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rab3gap1Q80UJ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms