Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC50.19■■■■■ 5.62
NischQ80TM9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.18■■■■■ 5.62
NischQ80TM9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC50.17■■■■■ 5.62
NischQ80TM9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC50.17■■■■■ 5.62
NischQ80TM9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC50.17■■■■■ 5.62
NischQ80TM9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
NischQ80TM9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
NischQ80TM9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.12■■■■■ 5.61
NischQ80TM9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.11■■■■■ 5.61
NischQ80TM9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.09■■■■■ 5.61
NischQ80TM9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.07■■■■■ 5.61
NischQ80TM9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.05■■■■■ 5.6
NischQ80TM9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC50.05■■■■■ 5.6
NischQ80TM9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC50.04■■■■■ 5.6
NischQ80TM9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC50.03■■■■■ 5.6
NischQ80TM9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.03■■■■■ 5.6
NischQ80TM9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
NischQ80TM9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
NischQ80TM9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.02■■■■■ 5.6
NischQ80TM9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
NischQ80TM9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC50■■■■■ 5.59
NischQ80TM9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
NischQ80TM9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.97■■■■■ 5.59
NischQ80TM9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
NischQ80TM9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC49.95■■■■■ 5.59
NischQ80TM9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.59
NischQ80TM9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.58
NischQ80TM9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC49.93■■■■■ 5.58
NischQ80TM9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.92■■■■■ 5.58
NischQ80TM9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.91■■■■■ 5.58
NischQ80TM9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC49.88■■■■■ 5.58
NischQ80TM9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
NischQ80TM9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC49.87■■■■■ 5.57
NischQ80TM9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
NischQ80TM9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
NischQ80TM9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC49.84■■■■■ 5.57
NischQ80TM9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
NischQ80TM9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC49.83■■■■■ 5.57
NischQ80TM9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC49.83■■■■■ 5.57
NischQ80TM9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
NischQ80TM9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
NischQ80TM9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.83■■■■■ 5.57
NischQ80TM9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
NischQ80TM9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.81■■■■■ 5.56
NischQ80TM9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC49.8■■■■■ 5.56
NischQ80TM9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC49.79■■■■■ 5.56
NischQ80TM9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
NischQ80TM9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
NischQ80TM9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC49.78■■■■■ 5.56
NischQ80TM9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
NischQ80TM9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
NischQ80TM9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC49.76■■■■■ 5.56
NischQ80TM9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
NischQ80TM9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
NischQ80TM9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
NischQ80TM9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC49.75■■■■■ 5.55
NischQ80TM9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC49.73■■■■■ 5.55
NischQ80TM9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
NischQ80TM9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
NischQ80TM9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
NischQ80TM9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC49.72■■■■■ 5.55
NischQ80TM9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.71■■■■■ 5.55
NischQ80TM9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.7■■■■■ 5.55
NischQ80TM9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
NischQ80TM9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.7■■■■■ 5.55
NischQ80TM9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
NischQ80TM9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
NischQ80TM9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
NischQ80TM9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
NischQ80TM9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
NischQ80TM9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC49.67■■■■■ 5.54
NischQ80TM9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC49.67■■■■■ 5.54
NischQ80TM9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
NischQ80TM9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.66■■■■■ 5.54
NischQ80TM9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
NischQ80TM9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC49.66■■■■■ 5.54
NischQ80TM9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.64■■■■■ 5.54
NischQ80TM9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC49.63■■■■■ 5.54
NischQ80TM9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
NischQ80TM9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC49.62■■■■■ 5.53
NischQ80TM9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC49.62■■■■■ 5.53
NischQ80TM9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
NischQ80TM9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
NischQ80TM9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
NischQ80TM9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC49.6■■■■■ 5.53
NischQ80TM9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC49.6■■■■■ 5.53
NischQ80TM9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
NischQ80TM9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC49.59■■■■■ 5.53
NischQ80TM9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC49.58■■■■■ 5.53
NischQ80TM9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC49.58■■■■■ 5.53
NischQ80TM9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
NischQ80TM9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
NischQ80TM9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC49.53■■■■■ 5.52
NischQ80TM9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC49.53■■■■■ 5.52
NischQ80TM9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC49.53■■■■■ 5.52
NischQ80TM9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC49.53■■■■■ 5.52
NischQ80TM9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.53■■■■■ 5.52
NischQ80TM9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC49.53■■■■■ 5.52
NischQ80TM9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC49.53■■■■■ 5.52
NischQ80TM9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
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