Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube2q1Q7TSS2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube2q1Q7TSS2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube2q1Q7TSS2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube2q1Q7TSS2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube2q1Q7TSS2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube2q1Q7TSS2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube2q1Q7TSS2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ube2q1Q7TSS2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube2q1Q7TSS2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube2q1Q7TSS2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube2q1Q7TSS2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube2q1Q7TSS2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ube2q1Q7TSS2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ube2q1Q7TSS2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube2q1Q7TSS2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ube2q1Q7TSS2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ube2q1Q7TSS2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ube2q1Q7TSS2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube2q1Q7TSS2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube2q1Q7TSS2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube2q1Q7TSS2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube2q1Q7TSS2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube2q1Q7TSS2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube2q1Q7TSS2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ube2q1Q7TSS2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ube2q1Q7TSS2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube2q1Q7TSS2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube2q1Q7TSS2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms