Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPZ8

Cpa1, Carboxypeptidase A1, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa1Q7TPZ8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpa1Q7TPZ8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpa1Q7TPZ8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpa1Q7TPZ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpa1Q7TPZ8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpa1Q7TPZ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpa1Q7TPZ8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpa1Q7TPZ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpa1Q7TPZ8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpa1Q7TPZ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpa1Q7TPZ8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpa1Q7TPZ8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpa1Q7TPZ8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpa1Q7TPZ8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpa1Q7TPZ8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpa1Q7TPZ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpa1Q7TPZ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpa1Q7TPZ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpa1Q7TPZ8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms