Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPW1

Nexn, Nexilin, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NexnQ7TPW1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NexnQ7TPW1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NexnQ7TPW1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NexnQ7TPW1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NexnQ7TPW1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NexnQ7TPW1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NexnQ7TPW1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NexnQ7TPW1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NexnQ7TPW1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NexnQ7TPW1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NexnQ7TPW1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NexnQ7TPW1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NexnQ7TPW1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NexnQ7TPW1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NexnQ7TPW1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NexnQ7TPW1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NexnQ7TPW1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NexnQ7TPW1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NexnQ7TPW1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NexnQ7TPW1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NexnQ7TPW1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NexnQ7TPW1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NexnQ7TPW1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NexnQ7TPW1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NexnQ7TPW1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NexnQ7TPW1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NexnQ7TPW1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NexnQ7TPW1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
NexnQ7TPW1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NexnQ7TPW1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NexnQ7TPW1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NexnQ7TPW1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NexnQ7TPW1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NexnQ7TPW1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NexnQ7TPW1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NexnQ7TPW1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NexnQ7TPW1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NexnQ7TPW1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NexnQ7TPW1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NexnQ7TPW1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NexnQ7TPW1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NexnQ7TPW1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NexnQ7TPW1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NexnQ7TPW1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NexnQ7TPW1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NexnQ7TPW1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NexnQ7TPW1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NexnQ7TPW1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms