Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SyncripQ7TMK9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SyncripQ7TMK9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SyncripQ7TMK9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SyncripQ7TMK9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SyncripQ7TMK9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 961 ms