Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SynmQ70IV5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SynmQ70IV5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
SynmQ70IV5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SynmQ70IV5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SynmQ70IV5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SynmQ70IV5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SynmQ70IV5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
SynmQ70IV5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SynmQ70IV5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SynmQ70IV5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SynmQ70IV5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SynmQ70IV5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SynmQ70IV5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SynmQ70IV5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
SynmQ70IV5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SynmQ70IV5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SynmQ70IV5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SynmQ70IV5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SynmQ70IV5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SynmQ70IV5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SynmQ70IV5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SynmQ70IV5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SynmQ70IV5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SynmQ70IV5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SynmQ70IV5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SynmQ70IV5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SynmQ70IV5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SynmQ70IV5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
SynmQ70IV5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SynmQ70IV5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SynmQ70IV5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SynmQ70IV5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SynmQ70IV5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SynmQ70IV5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SynmQ70IV5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
SynmQ70IV5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SynmQ70IV5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SynmQ70IV5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SynmQ70IV5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SynmQ70IV5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SynmQ70IV5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SynmQ70IV5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SynmQ70IV5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SynmQ70IV5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SynmQ70IV5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SynmQ70IV5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SynmQ70IV5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SynmQ70IV5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SynmQ70IV5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SynmQ70IV5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SynmQ70IV5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SynmQ70IV5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
SynmQ70IV5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SynmQ70IV5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SynmQ70IV5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SynmQ70IV5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SynmQ70IV5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SynmQ70IV5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SynmQ70IV5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SynmQ70IV5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SynmQ70IV5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SynmQ70IV5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SynmQ70IV5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SynmQ70IV5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SynmQ70IV5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SynmQ70IV5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SynmQ70IV5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SynmQ70IV5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SynmQ70IV5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SynmQ70IV5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SynmQ70IV5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SynmQ70IV5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SynmQ70IV5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
SynmQ70IV5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
SynmQ70IV5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
SynmQ70IV5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
SynmQ70IV5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SynmQ70IV5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
SynmQ70IV5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SynmQ70IV5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms