Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnt1Q6ZPR4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnt1Q6ZPR4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kcnt1Q6ZPR4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kcnt1Q6ZPR4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnt1Q6ZPR4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnt1Q6ZPR4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnt1Q6ZPR4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnt1Q6ZPR4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnt1Q6ZPR4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnt1Q6ZPR4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnt1Q6ZPR4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnt1Q6ZPR4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnt1Q6ZPR4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnt1Q6ZPR4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnt1Q6ZPR4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnt1Q6ZPR4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnt1Q6ZPR4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Kcnt1Q6ZPR4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcnt1Q6ZPR4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnt1Q6ZPR4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms