Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ube2oQ6ZPJ3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ube2oQ6ZPJ3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ube2oQ6ZPJ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ube2oQ6ZPJ3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ube2oQ6ZPJ3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ube2oQ6ZPJ3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ube2oQ6ZPJ3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ube2oQ6ZPJ3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ube2oQ6ZPJ3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ube2oQ6ZPJ3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ube2oQ6ZPJ3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ube2oQ6ZPJ3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ube2oQ6ZPJ3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ube2oQ6ZPJ3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ube2oQ6ZPJ3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ube2oQ6ZPJ3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ube2oQ6ZPJ3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ube2oQ6ZPJ3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ube2oQ6ZPJ3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ube2oQ6ZPJ3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ube2oQ6ZPJ3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ube2oQ6ZPJ3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ube2oQ6ZPJ3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ube2oQ6ZPJ3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ube2oQ6ZPJ3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ube2oQ6ZPJ3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ube2oQ6ZPJ3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ube2oQ6ZPJ3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ube2oQ6ZPJ3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ube2oQ6ZPJ3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ube2oQ6ZPJ3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ube2oQ6ZPJ3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ube2oQ6ZPJ3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ube2oQ6ZPJ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ube2oQ6ZPJ3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ube2oQ6ZPJ3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ube2oQ6ZPJ3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube2oQ6ZPJ3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube2oQ6ZPJ3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube2oQ6ZPJ3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube2oQ6ZPJ3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube2oQ6ZPJ3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube2oQ6ZPJ3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube2oQ6ZPJ3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube2oQ6ZPJ3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ube2oQ6ZPJ3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Ube2oQ6ZPJ3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ube2oQ6ZPJ3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms