Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Opn5Q6VZZ7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Opn5Q6VZZ7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Opn5Q6VZZ7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn5Q6VZZ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn5Q6VZZ7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn5Q6VZZ7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Opn5Q6VZZ7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Opn5Q6VZZ7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Opn5Q6VZZ7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Opn5Q6VZZ7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Opn5Q6VZZ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Opn5Q6VZZ7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Opn5Q6VZZ7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Opn5Q6VZZ7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Opn5Q6VZZ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Opn5Q6VZZ7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Opn5Q6VZZ7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Opn5Q6VZZ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Opn5Q6VZZ7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn5Q6VZZ7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn5Q6VZZ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn5Q6VZZ7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Opn5Q6VZZ7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms