Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc85bQ6PDY0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc85bQ6PDY0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc85bQ6PDY0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms