Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Herc4Q6PAV2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Herc4Q6PAV2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Herc4Q6PAV2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Herc4Q6PAV2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Herc4Q6PAV2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Herc4Q6PAV2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Herc4Q6PAV2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Herc4Q6PAV2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Herc4Q6PAV2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Herc4Q6PAV2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Herc4Q6PAV2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Herc4Q6PAV2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Herc4Q6PAV2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Herc4Q6PAV2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Herc4Q6PAV2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Herc4Q6PAV2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Herc4Q6PAV2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Herc4Q6PAV2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Herc4Q6PAV2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Herc4Q6PAV2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Herc4Q6PAV2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Herc4Q6PAV2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Herc4Q6PAV2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Herc4Q6PAV2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Herc4Q6PAV2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Herc4Q6PAV2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Herc4Q6PAV2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Herc4Q6PAV2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Herc4Q6PAV2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Herc4Q6PAV2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms