Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx19Q6P4T1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx19Q6P4T1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx19Q6P4T1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx19Q6P4T1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx19Q6P4T1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx19Q6P4T1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx19Q6P4T1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx19Q6P4T1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx19Q6P4T1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx19Q6P4T1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx19Q6P4T1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx19Q6P4T1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx19Q6P4T1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx19Q6P4T1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx19Q6P4T1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx19Q6P4T1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx19Q6P4T1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx19Q6P4T1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx19Q6P4T1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx19Q6P4T1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx19Q6P4T1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx19Q6P4T1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx19Q6P4T1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx19Q6P4T1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx19Q6P4T1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx19Q6P4T1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx19Q6P4T1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx19Q6P4T1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx19Q6P4T1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx19Q6P4T1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx19Q6P4T1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx19Q6P4T1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx19Q6P4T1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx19Q6P4T1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx19Q6P4T1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx19Q6P4T1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx19Q6P4T1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx19Q6P4T1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx19Q6P4T1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx19Q6P4T1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms