Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sik3Q6P4S6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Sik3Q6P4S6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sik3Q6P4S6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sik3Q6P4S6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sik3Q6P4S6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sik3Q6P4S6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sik3Q6P4S6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sik3Q6P4S6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sik3Q6P4S6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Sik3Q6P4S6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sik3Q6P4S6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sik3Q6P4S6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sik3Q6P4S6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sik3Q6P4S6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sik3Q6P4S6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sik3Q6P4S6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sik3Q6P4S6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sik3Q6P4S6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sik3Q6P4S6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sik3Q6P4S6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sik3Q6P4S6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sik3Q6P4S6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sik3Q6P4S6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Sik3Q6P4S6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sik3Q6P4S6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sik3Q6P4S6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sik3Q6P4S6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sik3Q6P4S6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sik3Q6P4S6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sik3Q6P4S6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sik3Q6P4S6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sik3Q6P4S6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sik3Q6P4S6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sik3Q6P4S6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sik3Q6P4S6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sik3Q6P4S6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sik3Q6P4S6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sik3Q6P4S6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sik3Q6P4S6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms