Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RbfaQ6P3B9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RbfaQ6P3B9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RbfaQ6P3B9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RbfaQ6P3B9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RbfaQ6P3B9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RbfaQ6P3B9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RbfaQ6P3B9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RbfaQ6P3B9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RbfaQ6P3B9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RbfaQ6P3B9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RbfaQ6P3B9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RbfaQ6P3B9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RbfaQ6P3B9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RbfaQ6P3B9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RbfaQ6P3B9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RbfaQ6P3B9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RbfaQ6P3B9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RbfaQ6P3B9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RbfaQ6P3B9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RbfaQ6P3B9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RbfaQ6P3B9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RbfaQ6P3B9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RbfaQ6P3B9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RbfaQ6P3B9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RbfaQ6P3B9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RbfaQ6P3B9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RbfaQ6P3B9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RbfaQ6P3B9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RbfaQ6P3B9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RbfaQ6P3B9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RbfaQ6P3B9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RbfaQ6P3B9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RbfaQ6P3B9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RbfaQ6P3B9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RbfaQ6P3B9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RbfaQ6P3B9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RbfaQ6P3B9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RbfaQ6P3B9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RbfaQ6P3B9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RbfaQ6P3B9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms