Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Slx4Q6P1D7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Slx4Q6P1D7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Slx4Q6P1D7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Slx4Q6P1D7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Slx4Q6P1D7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Slx4Q6P1D7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Slx4Q6P1D7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Slx4Q6P1D7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Slx4Q6P1D7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Slx4Q6P1D7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Slx4Q6P1D7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Slx4Q6P1D7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Slx4Q6P1D7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Slx4Q6P1D7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Slx4Q6P1D7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Slx4Q6P1D7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Slx4Q6P1D7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Slx4Q6P1D7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Slx4Q6P1D7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Slx4Q6P1D7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Slx4Q6P1D7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Slx4Q6P1D7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Slx4Q6P1D7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Slx4Q6P1D7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Slx4Q6P1D7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Slx4Q6P1D7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Slx4Q6P1D7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Slx4Q6P1D7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Slx4Q6P1D7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Slx4Q6P1D7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Slx4Q6P1D7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Slx4Q6P1D7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Slx4Q6P1D7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Slx4Q6P1D7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Slx4Q6P1D7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Slx4Q6P1D7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Slx4Q6P1D7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Slx4Q6P1D7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Slx4Q6P1D7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Slx4Q6P1D7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Slx4Q6P1D7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Slx4Q6P1D7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Slx4Q6P1D7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Slx4Q6P1D7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Slx4Q6P1D7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Slx4Q6P1D7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Slx4Q6P1D7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Slx4Q6P1D7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Slx4Q6P1D7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Slx4Q6P1D7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Slx4Q6P1D7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Slx4Q6P1D7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Slx4Q6P1D7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
Slx4Q6P1D7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Slx4Q6P1D7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Slx4Q6P1D7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Slx4Q6P1D7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Slx4Q6P1D7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Slx4Q6P1D7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Slx4Q6P1D7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Slx4Q6P1D7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Slx4Q6P1D7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Slx4Q6P1D7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Slx4Q6P1D7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Slx4Q6P1D7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Slx4Q6P1D7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Slx4Q6P1D7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Slx4Q6P1D7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Slx4Q6P1D7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Slx4Q6P1D7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Slx4Q6P1D7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Slx4Q6P1D7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Slx4Q6P1D7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Slx4Q6P1D7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Slx4Q6P1D7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Slx4Q6P1D7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Slx4Q6P1D7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Slx4Q6P1D7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Slx4Q6P1D7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Slx4Q6P1D7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Slx4Q6P1D7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Slx4Q6P1D7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Slx4Q6P1D7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Slx4Q6P1D7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Slx4Q6P1D7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Slx4Q6P1D7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Slx4Q6P1D7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Slx4Q6P1D7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Slx4Q6P1D7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Slx4Q6P1D7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Slx4Q6P1D7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Slx4Q6P1D7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Slx4Q6P1D7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Slx4Q6P1D7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Slx4Q6P1D7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Slx4Q6P1D7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Slx4Q6P1D7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Slx4Q6P1D7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Slx4Q6P1D7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms