Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frem2Q6NVD0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frem2Q6NVD0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frem2Q6NVD0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Frem2Q6NVD0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frem2Q6NVD0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Frem2Q6NVD0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frem2Q6NVD0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frem2Q6NVD0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frem2Q6NVD0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frem2Q6NVD0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Frem2Q6NVD0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frem2Q6NVD0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frem2Q6NVD0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frem2Q6NVD0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frem2Q6NVD0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frem2Q6NVD0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frem2Q6NVD0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frem2Q6NVD0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frem2Q6NVD0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frem2Q6NVD0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frem2Q6NVD0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Frem2Q6NVD0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frem2Q6NVD0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frem2Q6NVD0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frem2Q6NVD0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frem2Q6NVD0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frem2Q6NVD0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frem2Q6NVD0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frem2Q6NVD0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frem2Q6NVD0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frem2Q6NVD0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms