Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpm4Q6IRU2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpm4Q6IRU2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tpm4Q6IRU2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tpm4Q6IRU2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm4Q6IRU2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm4Q6IRU2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm4Q6IRU2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm4Q6IRU2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm4Q6IRU2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpm4Q6IRU2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tpm4Q6IRU2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpm4Q6IRU2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpm4Q6IRU2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm4Q6IRU2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.6 ms