Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt42Q6IFX2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt42Q6IFX2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt42Q6IFX2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt42Q6IFX2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt42Q6IFX2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt42Q6IFX2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt42Q6IFX2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt42Q6IFX2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt42Q6IFX2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt42Q6IFX2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt42Q6IFX2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt42Q6IFX2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt42Q6IFX2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt42Q6IFX2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt42Q6IFX2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt42Q6IFX2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt42Q6IFX2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt42Q6IFX2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt42Q6IFX2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt42Q6IFX2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt42Q6IFX2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt42Q6IFX2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms