Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd2Q6DVA0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lemd2Q6DVA0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lemd2Q6DVA0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lemd2Q6DVA0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lemd2Q6DVA0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lemd2Q6DVA0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd2Q6DVA0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lemd2Q6DVA0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms