Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms