Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr2kQ63871 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr2kQ63871 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr2kQ63871 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms