Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TrhQ62361 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TrhQ62361 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TrhQ62361 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TrhQ62361 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TrhQ62361 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TrhQ62361 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TrhQ62361 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TrhQ62361 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TrhQ62361 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TrhQ62361 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TrhQ62361 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TrhQ62361 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TrhQ62361 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TrhQ62361 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TrhQ62361 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TrhQ62361 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TrhQ62361 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TrhQ62361 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TrhQ62361 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TrhQ62361 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TrhQ62361 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TrhQ62361 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TrhQ62361 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TrhQ62361 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TrhQ62361 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TrhQ62361 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TrhQ62361 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TrhQ62361 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TrhQ62361 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TrhQ62361 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TrhQ62361 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TrhQ62361 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TrhQ62361 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TrhQ62361 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TrhQ62361 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TrhQ62361 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TrhQ62361 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TrhQ62361 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TrhQ62361 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TrhQ62361 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TrhQ62361 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TrhQ62361 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TrhQ62361 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TrhQ62361 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TrhQ62361 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TrhQ62361 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TrhQ62361 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TrhQ62361 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TrhQ62361 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TrhQ62361 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TrhQ62361 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TrhQ62361 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TrhQ62361 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TrhQ62361 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TrhQ62361 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TrhQ62361 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TrhQ62361 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TrhQ62361 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TrhQ62361 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TrhQ62361 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TrhQ62361 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TrhQ62361 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TrhQ62361 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TrhQ62361 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TrhQ62361 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TrhQ62361 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TrhQ62361 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TrhQ62361 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TrhQ62361 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TrhQ62361 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TrhQ62361 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TrhQ62361 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TrhQ62361 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TrhQ62361 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TrhQ62361 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TrhQ62361 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TrhQ62361 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms