Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scn9aQ62205 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Scn9aQ62205 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Scn9aQ62205 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Scn9aQ62205 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Scn9aQ62205 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Scn9aQ62205 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Scn9aQ62205 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Scn9aQ62205 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Scn9aQ62205 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scn9aQ62205 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scn9aQ62205 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Scn9aQ62205 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Scn9aQ62205 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scn9aQ62205 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scn9aQ62205 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scn9aQ62205 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Scn9aQ62205 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Scn9aQ62205 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Scn9aQ62205 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Scn9aQ62205 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Scn9aQ62205 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Scn9aQ62205 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scn9aQ62205 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Scn9aQ62205 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scn9aQ62205 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Scn9aQ62205 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scn9aQ62205 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scn9aQ62205 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Scn9aQ62205 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scn9aQ62205 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scn9aQ62205 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scn9aQ62205 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scn9aQ62205 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Scn9aQ62205 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Scn9aQ62205 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Scn9aQ62205 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Scn9aQ62205 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scn9aQ62205 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scn9aQ62205 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Scn9aQ62205 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scn9aQ62205 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scn9aQ62205 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scn9aQ62205 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Scn9aQ62205 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Scn9aQ62205 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scn9aQ62205 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Scn9aQ62205 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scn9aQ62205 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Scn9aQ62205 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scn9aQ62205 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn9aQ62205 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn9aQ62205 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn9aQ62205 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn9aQ62205 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scn9aQ62205 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scn9aQ62205 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scn9aQ62205 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn9aQ62205 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms