Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttf1Q62187 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ttf1Q62187 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Ttf1Q62187 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttf1Q62187 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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