Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aldh1a2Q62148 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Aldh1a2Q62148 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh1a2Q62148 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh1a2Q62148 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh1a2Q62148 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh1a2Q62148 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh1a2Q62148 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1a2Q62148 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1a2Q62148 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1a2Q62148 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1a2Q62148 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1a2Q62148 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1a2Q62148 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aldh1a2Q62148 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aldh1a2Q62148 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aldh1a2Q62148 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aldh1a2Q62148 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aldh1a2Q62148 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aldh1a2Q62148 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aldh1a2Q62148 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aldh1a2Q62148 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Aldh1a2Q62148 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Aldh1a2Q62148 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aldh1a2Q62148 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aldh1a2Q62148 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aldh1a2Q62148 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aldh1a2Q62148 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Aldh1a2Q62148 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aldh1a2Q62148 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aldh1a2Q62148 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aldh1a2Q62148 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aldh1a2Q62148 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aldh1a2Q62148 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aldh1a2Q62148 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aldh1a2Q62148 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aldh1a2Q62148 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aldh1a2Q62148 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aldh1a2Q62148 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aldh1a2Q62148 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aldh1a2Q62148 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aldh1a2Q62148 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms