Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn1Q61809 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn1Q61809 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn1Q61809 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn1Q61809 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn1Q61809 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn1Q61809 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn1Q61809 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrn1Q61809 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrn1Q61809 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrn1Q61809 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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