Protein–RNA interactions for Protein: Q61288

Acvrl1, Serine/threonine-protein kinase receptor R3, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvrl1Q61288 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Acvrl1Q61288 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Acvrl1Q61288 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Acvrl1Q61288 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Acvrl1Q61288 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Acvrl1Q61288 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Acvrl1Q61288 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Acvrl1Q61288 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Acvrl1Q61288 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Acvrl1Q61288 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Acvrl1Q61288 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Acvrl1Q61288 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Acvrl1Q61288 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Acvrl1Q61288 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Acvrl1Q61288 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Acvrl1Q61288 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Acvrl1Q61288 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Acvrl1Q61288 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Acvrl1Q61288 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Acvrl1Q61288 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Acvrl1Q61288 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Acvrl1Q61288 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Acvrl1Q61288 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Acvrl1Q61288 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Acvrl1Q61288 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Acvrl1Q61288 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Acvrl1Q61288 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Acvrl1Q61288 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Acvrl1Q61288 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Acvrl1Q61288 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Acvrl1Q61288 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Acvrl1Q61288 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Acvrl1Q61288 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Acvrl1Q61288 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Acvrl1Q61288 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Acvrl1Q61288 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Acvrl1Q61288 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Acvrl1Q61288 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Acvrl1Q61288 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Acvrl1Q61288 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms