Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc9a1Q61165 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc9a1Q61165 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slc9a1Q61165 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc9a1Q61165 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc9a1Q61165 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc9a1Q61165 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc9a1Q61165 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc9a1Q61165 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc9a1Q61165 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc9a1Q61165 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc9a1Q61165 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc9a1Q61165 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms