Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift20Q61025 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift20Q61025 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ift20Q61025 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ift20Q61025 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms