Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JrkQ60976 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
JrkQ60976 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
JrkQ60976 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
JrkQ60976 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
JrkQ60976 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
JrkQ60976 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
JrkQ60976 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
JrkQ60976 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
JrkQ60976 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
JrkQ60976 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
JrkQ60976 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
JrkQ60976 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JrkQ60976 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JrkQ60976 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JrkQ60976 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JrkQ60976 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JrkQ60976 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JrkQ60976 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
JrkQ60976 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
JrkQ60976 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
JrkQ60976 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
JrkQ60976 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
JrkQ60976 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
JrkQ60976 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
JrkQ60976 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
JrkQ60976 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
JrkQ60976 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
JrkQ60976 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
JrkQ60976 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
JrkQ60976 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
JrkQ60976 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
JrkQ60976 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
JrkQ60976 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
JrkQ60976 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
JrkQ60976 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
JrkQ60976 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
JrkQ60976 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
JrkQ60976 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
JrkQ60976 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
JrkQ60976 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
JrkQ60976 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
JrkQ60976 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
JrkQ60976 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
JrkQ60976 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JrkQ60976 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JrkQ60976 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
JrkQ60976 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
JrkQ60976 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
JrkQ60976 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
JrkQ60976 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
JrkQ60976 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
JrkQ60976 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
JrkQ60976 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
JrkQ60976 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
JrkQ60976 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms