Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ncor1Q60974 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncor1Q60974 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncor1Q60974 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncor1Q60974 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncor1Q60974 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncor1Q60974 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncor1Q60974 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncor1Q60974 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncor1Q60974 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncor1Q60974 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncor1Q60974 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncor1Q60974 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncor1Q60974 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ncor1Q60974 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ncor1Q60974 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncor1Q60974 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncor1Q60974 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncor1Q60974 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncor1Q60974 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncor1Q60974 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncor1Q60974 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncor1Q60974 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncor1Q60974 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncor1Q60974 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncor1Q60974 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncor1Q60974 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncor1Q60974 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncor1Q60974 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ncor1Q60974 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncor1Q60974 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncor1Q60974 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncor1Q60974 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncor1Q60974 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncor1Q60974 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncor1Q60974 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncor1Q60974 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncor1Q60974 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncor1Q60974 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncor1Q60974 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncor1Q60974 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncor1Q60974 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ncor1Q60974 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncor1Q60974 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ncor1Q60974 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncor1Q60974 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncor1Q60974 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncor1Q60974 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms