Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cldn11Q60771 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn11Q60771 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn11Q60771 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn11Q60771 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn11Q60771 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldn11Q60771 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldn11Q60771 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldn11Q60771 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn11Q60771 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn11Q60771 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cldn11Q60771 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn11Q60771 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn11Q60771 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn11Q60771 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cldn11Q60771 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cldn11Q60771 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn11Q60771 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn11Q60771 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn11Q60771 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn11Q60771 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn11Q60771 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn11Q60771 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn11Q60771 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn11Q60771 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cldn11Q60771 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Cldn11Q60771 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn11Q60771 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cldn11Q60771 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn11Q60771 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn11Q60771 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn11Q60771 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn11Q60771 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn11Q60771 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn11Q60771 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cldn11Q60771 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cldn11Q60771 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cldn11Q60771 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn11Q60771 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn11Q60771 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn11Q60771 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn11Q60771 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn11Q60771 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn11Q60771 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn11Q60771 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn11Q60771 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms