Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Stxbp3Q60770 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Stxbp3Q60770 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Stxbp3Q60770 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Stxbp3Q60770 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Stxbp3Q60770 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Stxbp3Q60770 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Stxbp3Q60770 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stxbp3Q60770 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stxbp3Q60770 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Stxbp3Q60770 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Stxbp3Q60770 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Stxbp3Q60770 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Stxbp3Q60770 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stxbp3Q60770 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stxbp3Q60770 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stxbp3Q60770 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stxbp3Q60770 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Stxbp3Q60770 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Stxbp3Q60770 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms