Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ClpbQ60649 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClpbQ60649 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClpbQ60649 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClpbQ60649 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClpbQ60649 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClpbQ60649 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms