Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc11Q5U458 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc11Q5U458 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc11Q5U458 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc11Q5U458 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc11Q5U458 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc11Q5U458 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc11Q5U458 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc11Q5U458 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc11Q5U458 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc11Q5U458 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc11Q5U458 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc11Q5U458 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc11Q5U458 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc11Q5U458 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc11Q5U458 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc11Q5U458 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc11Q5U458 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc11Q5U458 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dnajc11Q5U458 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc11Q5U458 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnajc11Q5U458 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dnajc11Q5U458 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms