Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r195Q5SVD6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r195Q5SVD6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms