Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sft2d1Q5SSN7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms