Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Bod1Q5SQY2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bod1Q5SQY2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bod1Q5SQY2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms