Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ecm2Q5FW85 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ecm2Q5FW85 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ecm2Q5FW85 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ecm2Q5FW85 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ecm2Q5FW85 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ecm2Q5FW85 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ecm2Q5FW85 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ecm2Q5FW85 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ecm2Q5FW85 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ecm2Q5FW85 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Ecm2Q5FW85 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ecm2Q5FW85 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ecm2Q5FW85 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ecm2Q5FW85 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ecm2Q5FW85 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ecm2Q5FW85 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ecm2Q5FW85 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ecm2Q5FW85 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Ecm2Q5FW85 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ecm2Q5FW85 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ecm2Q5FW85 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ecm2Q5FW85 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ecm2Q5FW85 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ecm2Q5FW85 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ecm2Q5FW85 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ecm2Q5FW85 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ecm2Q5FW85 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ecm2Q5FW85 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ecm2Q5FW85 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Ecm2Q5FW85 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Ecm2Q5FW85 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ecm2Q5FW85 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ecm2Q5FW85 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ecm2Q5FW85 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Ecm2Q5FW85 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ecm2Q5FW85 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ecm2Q5FW85 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ecm2Q5FW85 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ecm2Q5FW85 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ecm2Q5FW85 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ecm2Q5FW85 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ecm2Q5FW85 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Ecm2Q5FW85 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Ecm2Q5FW85 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ecm2Q5FW85 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ecm2Q5FW85 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ecm2Q5FW85 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ecm2Q5FW85 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Ecm2Q5FW85 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ecm2Q5FW85 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ecm2Q5FW85 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ecm2Q5FW85 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ecm2Q5FW85 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ecm2Q5FW85 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ecm2Q5FW85 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ecm2Q5FW85 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ecm2Q5FW85 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ecm2Q5FW85 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ecm2Q5FW85 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ecm2Q5FW85 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ecm2Q5FW85 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ecm2Q5FW85 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ecm2Q5FW85 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ecm2Q5FW85 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ecm2Q5FW85 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ecm2Q5FW85 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ecm2Q5FW85 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ecm2Q5FW85 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ecm2Q5FW85 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ecm2Q5FW85 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ecm2Q5FW85 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ecm2Q5FW85 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ecm2Q5FW85 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ecm2Q5FW85 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ecm2Q5FW85 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ecm2Q5FW85 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ecm2Q5FW85 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Ecm2Q5FW85 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
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